Die Schulkonferenz ist das oberste Mitwirkungsgremium der Schule, in dem alle an der Bildungs- und Erziehungsarbeit der Schule Beteiligten zusammenwirken. Sie berät in grundsätzlichen Angelegenheiten der Schule, vermittelt bei Konflikten innerhalb der Schule und kann Vorschläge und Anregungen an den Schulträger und an die Schulaufsichtsbehörde richten.
Mitglieder der Schulkonferenz sind die Schulleiterin oder der Schulleiter sowie die gewählte Vertretung der Lehrerinnen und Lehrer, Eltern, Schülerinnen und Schüler im Verhältnis 1 :1 : 1. Am Goerdeler-Gymnasium hat die Schulkonferenz 18 Mitglieder, also jeweils 6 Elternvertreter, 6 Schüler/-innen und 6 Lehrer/-innen.
| Lehrer/innen | Eltern | Schüler/innen |
| Herr Baaske | Herr Bonorden | A. Alageswaren EF |
| Frau Berger | Frau Dr. Jensen | A. Altajev EF |
| Frau Bunse | Frau Müller | J. Buddensiek Q1 |
| Herr Fritz | Frau Pollmann | M. Hampel Q1 |
| Herr Niggemann | Frau Schmidt | J. Pollmann EF |
| Frau Nowak-Borgmeier | Herr Thöne | C. Warsitz 10c |